La bentonite grazie alle sue capacità di scambio ionico, flocculazione e sedimentazione viene utilizzata nel settore della protezione ambientale per la chiarificazione delle acque e l’inertizzazione dei fanghi .
Nel trattamento delle acque la bentonite viene considerata un agente chiarificante di tipo minerale così come il policloruro di alluminio, il solfato di alluminio, il solfato ferroso e il cloruro ferrico, tuttavia data la sua insolubilità è l’unico agente in grado di formare delle sospensioni (slurry ) stabili nel tempo. La bentonite inoltre “cattura” i metalli inquinanti grazie al processo di scambio ionico nel quale avviene la sostituzione degli anioni sodio legati superficialmente all’argilla con i cationi metallici contaminati.